南通县南山寺位于金沙镇西北,原名头总庵,建年不详。现庵内有古银杏一株,亦是百年之物。僧尼相传今已有26代,是一座历史然久的庵院。
头总庵于1988年12月20日开放。称为金沙头总磨念佛堂,庵堂为四合院建筑,庵门期西,现有房16间约200平方米,寺院约占地一亩半。
1991年10月14日,经南通市人民政府批准,金沙头总庵念佛堂开格为南山寺。